一、公司特别清算的费用
公司特别清算的费用，包括公告费、信件邮寄费、通讯费、办公费、差旅费、财产保管费、评估拍卖费、聘请中介机构人员报酬、聘用清算工作人员工资等。清算费用由公司承担，这自无疑问。但是，由于特别清算是由债权人申请而发动的，在被申请的公司不能提供公告费、信件邮寄费、办公费、聘请中介机构人员报酬、聘请工作人员工资等清算启动资金时，应当由提出申请的债权人垫付，待公司的财产拍卖后，作为公司公益债权，优先偿还。
二、特别清算的优势
与破产清算相比，特别清算的优势主要体现在其在保障债权人公平受偿的同时，也兼顾了效率的实现。破产制度虽可以保障债权人公平受偿的权利，但当事人往往需要花费巨大的精力、时间与费用。这种成本在当事人自愿或财产已经显著匮乏的情况下是合理的，因为这是追求公平受偿所付出的必要代价。但是，如果公司的债权人并不多，利害关系人很容易达成某种协议，进入破产程序可就并不是当事人的最佳选择。考虑到破产程序会耗费巨大的时间、精力与费用，当事人可能会选择以比较简便、快速的特别清算方式解决企业的清算问题。这时，如果法律强行规定，只要资不抵债便要进行破产清算，那么，无异于是对当事人意思自治的一种强奸。
